In der Volksheilkunde wird die Eberraute als Bittertonikum, das die Verdauungsfunktionen stützt und stärkt, indem es Magen und Darm zu vermehrter Selektion anregt, gegen Appetitlosigkeit verabreicht. Außerdem wird sie als Mittel gegen Faden- und Spulwürmer im Verdauungstrakt eingesetzt. Eberraute hilft auch, eine unregelmäßige oder ausbleibende Periode einzuleiten, weshalb Schwangere Eberrauten-Präparate nicht unbedenklich einnehmen sollten.
